A Unidade de Endoscopia da Santa Casa de Misericórdia de São José do Rio Preto, está localizada a Rua Siqueira Campos, em anexo ao complexo Hospitalar. Possui sala de recepção, onde o paciente poderá agendar seus exames, tirar dúvidas e receber resultados dos procedimentos e biópsias realizada. Conta ainda com sala de recuperação anestésica ampla e duas salas de exames, todas com aparelhos de última
geração para dar todo  o suporte necessário e segurança durante a realização dos procedimentos endoscópicos.